為執行教育部獎勵大學教學卓越計畫,本校於民國97年9月成立「教學卓越計畫辦公室」,並於民國98年9月升格為「教學卓越中心」。

民國99年8月,為提升本校教師專業,並統整全校性教學計畫、數位教學與服務學習等事項,整併教師發展中心、教學卓越中心、服務學習中心、健康促進中心等單位,並依據本校組織規程第四條規定,設置「慈濟大學教師發展暨教學資源中心」。

民國103年8月,因應慈濟大學、慈濟科技大學兩校合併之業務規劃,本中心改名為「慈濟大學教學暨學習資源中心」(以下簡稱本中心)。

本中心置主任一人,綜理中心各項業務。其下設學習資源組、教師專業組、數位教學組、臨床醫學教育組、服務學習組與執行暨管考組。各組分置組長一人、職員若干人,辦理各項事務。